Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Tns3Q5SSZ5 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Tns3Q5SSZ5 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Tns3Q5SSZ5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Tns3Q5SSZ5 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Tns3Q5SSZ5 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Tns3Q5SSZ5 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Tns3Q5SSZ5 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Tns3Q5SSZ5 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Tns3Q5SSZ5 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Tns3Q5SSZ5 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Tns3Q5SSZ5 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tns3Q5SSZ5 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms