Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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