Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms