Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U595 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U595 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U595 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U595 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U595 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U595 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U595 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U595 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U595 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U595 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U595 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U595 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U595 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U595 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U595 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U595 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U595 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U595 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U595 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U595 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U595 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U595 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U595 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U595 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U595 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U595 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U595 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U595 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U595 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U595 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U595 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U595 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U595 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U595 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U595 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U595 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U595 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms