Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Kdm4dQ3U2K5 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Kdm4dQ3U2K5 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
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