Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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