Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VgfQ0VGU4 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms