Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znf541Q0GGX2 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znf541Q0GGX2 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znf541Q0GGX2 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znf541Q0GGX2 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znf541Q0GGX2 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znf541Q0GGX2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znf541Q0GGX2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znf541Q0GGX2 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znf541Q0GGX2 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znf541Q0GGX2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf541Q0GGX2 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf541Q0GGX2 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf541Q0GGX2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf541Q0GGX2 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf541Q0GGX2 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf541Q0GGX2 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf541Q0GGX2 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf541Q0GGX2 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf541Q0GGX2 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf541Q0GGX2 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf541Q0GGX2 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf541Q0GGX2 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf541Q0GGX2 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf541Q0GGX2 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf541Q0GGX2 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf541Q0GGX2 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms