Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Pcdh18-202ENSMUST00000191794 5146 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Arhgap32-206ENSMUST00000182802 5621 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Morc2a-201ENSMUST00000093389 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Epb41l4a-201ENSMUST00000025234 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Mcc-201ENSMUST00000089874 7858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Lrat-201ENSMUST00000029632 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Ncoa1-209ENSMUST00000220434 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Gm19410-201ENSMUST00000207505 6352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
NrepQ07475 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Adgrl3-204ENSMUST00000117407 5705 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms