Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cntn3Q07409 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms