Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms