Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms