Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SelpQ01102 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelpQ01102 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelpQ01102 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelpQ01102 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelpQ01102 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelpQ01102 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelpQ01102 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelpQ01102 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelpQ01102 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelpQ01102 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelpQ01102 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms