Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Arf1P84078 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Arf1P84078 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Arf1P84078 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arf1P84078 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Arf1P84078 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Arf1P84078 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Arf1P84078 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Arf1P84078 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arf1P84078 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arf1P84078 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
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Arf1P84078 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms