Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx1P81068 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx1P81068 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx1P81068 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx1P81068 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx1P81068 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx1P81068 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx1P81068 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx1P81068 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx1P81068 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Irx1P81068 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Irx1P81068 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Irx1P81068 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Irx1P81068 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Irx1P81068 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Irx1P81068 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx1P81068 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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