Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
UbdP63072 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
UbdP63072 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
UbdP63072 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
UbdP63072 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
UbdP63072 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
UbdP63072 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
UbdP63072 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
UbdP63072 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
UbdP63072 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
UbdP63072 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
UbdP63072 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
UbdP63072 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
UbdP63072 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
UbdP63072 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
UbdP63072 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
UbdP63072 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
UbdP63072 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
UbdP63072 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
UbdP63072 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
UbdP63072 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
UbdP63072 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
UbdP63072 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
UbdP63072 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
UbdP63072 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
UbdP63072 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
UbdP63072 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
UbdP63072 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
UbdP63072 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UbdP63072 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UbdP63072 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UbdP63072 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UbdP63072 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UbdP63072 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
UbdP63072 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UbdP63072 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UbdP63072 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UbdP63072 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UbdP63072 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UbdP63072 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UbdP63072 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms