Protein–RNA interactions for Protein: P62270

Rps18, 40S ribosomal protein S18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps18P62270 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps18P62270 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps18P62270 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps18P62270 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps18P62270 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps18P62270 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps18P62270 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps18P62270 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps18P62270 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps18P62270 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps18P62270 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps18P62270 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps18P62270 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps18P62270 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms