Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms