Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
GferP56213 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
GferP56213 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
GferP56213 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
GferP56213 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
GferP56213 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
GferP56213 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GferP56213 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GferP56213 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
GferP56213 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
GferP56213 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
GferP56213 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GferP56213 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GferP56213 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GferP56213 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GferP56213 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GferP56213 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
GferP56213 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GferP56213 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
GferP56213 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GferP56213 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GferP56213 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GferP56213 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GferP56213 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GferP56213 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GferP56213 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GferP56213 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GferP56213 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GferP56213 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GferP56213 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GferP56213 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GferP56213 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
GferP56213 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GferP56213 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GferP56213 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms