Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Tmem56-207ENSMUST00000155309 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms