Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NodalP43021 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NodalP43021 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NodalP43021 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NodalP43021 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NodalP43021 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NodalP43021 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NodalP43021 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NodalP43021 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NodalP43021 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NodalP43021 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NodalP43021 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NodalP43021 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NodalP43021 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
NodalP43021 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NodalP43021 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NodalP43021 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NodalP43021 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NodalP43021 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NodalP43021 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NodalP43021 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
NodalP43021 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NodalP43021 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NodalP43021 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NodalP43021 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NodalP43021 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NodalP43021 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
NodalP43021 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
NodalP43021 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NodalP43021 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NodalP43021 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NodalP43021 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NodalP43021 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
NodalP43021 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
NodalP43021 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NodalP43021 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
NodalP43021 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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NodalP43021 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
NodalP43021 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
NodalP43021 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
NodalP43021 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
NodalP43021 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
NodalP43021 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
NodalP43021 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NodalP43021 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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NodalP43021 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
NodalP43021 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
NodalP43021 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NodalP43021 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NodalP43021 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NodalP43021 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NodalP43021 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NodalP43021 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NodalP43021 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NodalP43021 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NodalP43021 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
NodalP43021 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
NodalP43021 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
NodalP43021 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
NodalP43021 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
NodalP43021 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
NodalP43021 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
NodalP43021 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NodalP43021 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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NodalP43021 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NodalP43021 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NodalP43021 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NodalP43021 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NodalP43021 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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NodalP43021 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NodalP43021 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NodalP43021 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NodalP43021 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NodalP43021 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NodalP43021 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NodalP43021 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NodalP43021 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NodalP43021 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NodalP43021 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NodalP43021 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NodalP43021 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NodalP43021 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
NodalP43021 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NodalP43021 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NodalP43021 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
NodalP43021 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NodalP43021 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
NodalP43021 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
NodalP43021 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
NodalP43021 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
NodalP43021 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NodalP43021 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NodalP43021 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NodalP43021 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
NodalP43021 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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