Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Pik3caP42337 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Pik3caP42337 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms