Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ThpoP40226 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ThpoP40226 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ThpoP40226 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ThpoP40226 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ThpoP40226 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ThpoP40226 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ThpoP40226 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ThpoP40226 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ThpoP40226 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ThpoP40226 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ThpoP40226 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms