Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms