Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms