Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
NdnP25233 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NdnP25233 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NdnP25233 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NdnP25233 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NdnP25233 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NdnP25233 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NdnP25233 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NdnP25233 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NdnP25233 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NdnP25233 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NdnP25233 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
NdnP25233 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NdnP25233 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NdnP25233 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NdnP25233 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NdnP25233 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NdnP25233 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NdnP25233 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NdnP25233 Kalrn-203ENSMUST00000114947 2922 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NdnP25233 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NdnP25233 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NdnP25233 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NdnP25233 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NdnP25233 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NdnP25233 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NdnP25233 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NdnP25233 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NdnP25233 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NdnP25233 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NdnP25233 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NdnP25233 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NdnP25233 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NdnP25233 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NdnP25233 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NdnP25233 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NdnP25233 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
NdnP25233 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NdnP25233 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NdnP25233 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
NdnP25233 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NdnP25233 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NdnP25233 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
NdnP25233 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NdnP25233 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NdnP25233 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NdnP25233 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NdnP25233 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NdnP25233 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NdnP25233 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NdnP25233 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NdnP25233 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NdnP25233 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NdnP25233 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NdnP25233 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NdnP25233 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NdnP25233 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NdnP25233 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NdnP25233 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NdnP25233 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NdnP25233 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NdnP25233 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NdnP25233 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NdnP25233 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NdnP25233 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NdnP25233 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NdnP25233 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NdnP25233 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NdnP25233 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NdnP25233 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NdnP25233 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NdnP25233 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NdnP25233 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NdnP25233 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NdnP25233 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
NdnP25233 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NdnP25233 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NdnP25233 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NdnP25233 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NdnP25233 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NdnP25233 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NdnP25233 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NdnP25233 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NdnP25233 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NdnP25233 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NdnP25233 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
NdnP25233 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NdnP25233 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NdnP25233 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NdnP25233 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
NdnP25233 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NdnP25233 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NdnP25233 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NdnP25233 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NdnP25233 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NdnP25233 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NdnP25233 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NdnP25233 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NdnP25233 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NdnP25233 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms