Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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Ggta1P23336 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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Ggta1P23336 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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Ggta1P23336 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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Ggta1P23336 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
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Ggta1P23336 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
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Ggta1P23336 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Ggta1P23336 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Ggta1P23336 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Ggta1P23336 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ggta1P23336 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Ggta1P23336 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms