Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb9P20615 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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