Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
NelfeP19426 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
NelfeP19426 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
NelfeP19426 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
NelfeP19426 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
NelfeP19426 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NelfeP19426 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NelfeP19426 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NelfeP19426 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NelfeP19426 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NelfeP19426 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NelfeP19426 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NelfeP19426 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NelfeP19426 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NelfeP19426 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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