Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm28445-201ENSMUST00000187686 1498 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm16284-201ENSMUST00000140995 400 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm37362-201ENSMUST00000194567 634 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm43803-202ENSMUST00000197765 580 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm31752-201ENSMUST00000199456 856 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm8952-201ENSMUST00000206828 1102 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Mrpl42-202ENSMUST00000217777 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 AC160114.3-201ENSMUST00000222256 560 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Klk1b22-201ENSMUST00000077528 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Vmn2r125-201ENSMUST00000096794 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Esp6-201ENSMUST00000097324 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Olfr1247-201ENSMUST00000099771 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Tsc22d1-207ENSMUST00000140251 670 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm5538-201ENSMUST00000168156 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms