Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tgfb1P04202 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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