Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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Timm44O35857 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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Timm44O35857 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Timm44O35857 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Timm44O35857 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Timm44O35857 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Timm44O35857 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Timm44O35857 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Timm44O35857 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Timm44O35857 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Timm44O35857 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timm44O35857 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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