Protein–RNA interactions for Protein: O09172

Gclm, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GclmO09172 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GclmO09172 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
GclmO09172 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
GclmO09172 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GclmO09172 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GclmO09172 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GclmO09172 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GclmO09172 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
GclmO09172 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
GclmO09172 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
GclmO09172 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GclmO09172 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
GclmO09172 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GclmO09172 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GclmO09172 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
GclmO09172 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GclmO09172 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GclmO09172 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GclmO09172 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GclmO09172 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GclmO09172 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GclmO09172 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GclmO09172 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GclmO09172 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GclmO09172 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GclmO09172 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GclmO09172 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GclmO09172 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
GclmO09172 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GclmO09172 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GclmO09172 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GclmO09172 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GclmO09172 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GclmO09172 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GclmO09172 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GclmO09172 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GclmO09172 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GclmO09172 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GclmO09172 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GclmO09172 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GclmO09172 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GclmO09172 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GclmO09172 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GclmO09172 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
GclmO09172 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
GclmO09172 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
GclmO09172 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GclmO09172 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GclmO09172 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GclmO09172 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GclmO09172 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
GclmO09172 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
GclmO09172 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GclmO09172 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
GclmO09172 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
GclmO09172 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GclmO09172 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
GclmO09172 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GclmO09172 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
GclmO09172 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
GclmO09172 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GclmO09172 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
GclmO09172 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
GclmO09172 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
GclmO09172 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
GclmO09172 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
GclmO09172 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
GclmO09172 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
GclmO09172 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
GclmO09172 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
GclmO09172 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
GclmO09172 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
GclmO09172 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
GclmO09172 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GclmO09172 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GclmO09172 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GclmO09172 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GclmO09172 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GclmO09172 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GclmO09172 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
GclmO09172 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GclmO09172 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GclmO09172 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GclmO09172 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GclmO09172 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GclmO09172 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GclmO09172 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GclmO09172 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
GclmO09172 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
GclmO09172 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GclmO09172 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GclmO09172 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
GclmO09172 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
GclmO09172 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GclmO09172 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GclmO09172 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
GclmO09172 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GclmO09172 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GclmO09172 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GclmO09172 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms