Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms