Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.7 ms