Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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