Protein–RNA interactions for Protein: H3BJN7

Gm20696, Predicted gene 20696, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20696H3BJN7 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms