Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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