Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms