Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm20807-201ENSMUST00000194687 1336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Itpa-ps1-201ENSMUST00000117207 597 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm5650-201ENSMUST00000209641 598 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm8226-201ENSMUST00000190511 798 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm6216-201ENSMUST00000182390 687 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms