Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Aff1-201ENSMUST00000031256 8312 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Mcc-201ENSMUST00000089874 7858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gramd1b-214ENSMUST00000216821 7445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Wdr62-201ENSMUST00000108190 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Plec-217ENSMUST00000169438 14827 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms