Protein–RNA interactions for Protein: A2A884

Hivep3, Transcription factor HIVEP3, mousemouse

Predictions only

Length 2,348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hivep3A2A884 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hivep3A2A884 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms