Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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Hdac6Q9Z2V5 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Hdac6Q9Z2V5 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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Hdac6Q9Z2V5 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Hdac6Q9Z2V5 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Hdac6Q9Z2V5 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Hdac6Q9Z2V5 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Hdac6Q9Z2V5 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Hdac6Q9Z2V5 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Hdac6Q9Z2V5 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Hdac6Q9Z2V5 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms