Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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