Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms