Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR0

Rnf25, E3 ubiquitin-protein ligase RNF25, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf25Q9QZR0 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Gm9877-201ENSMUST00000064271 2627 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms