Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
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