Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nectin3Q9JLB9 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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