Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upk3aQ9JKX8 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms