Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms